El estudio de estos hongos estará en función del objetivo o pregunta de investigación que busquemos responder.

​

Podemos estudiarlos a partir de las raíces, suelo o búsqueda activa de esporocárpos en materiales orgánicos

​

• Directamente en el interior de las raíces a través de la observación y estimación de la colonización micorrízica.

​

• Del suelo mineral mediante el aislamiento de sus esporas (estructuras de resistencia y dispersión) en el suelo rizosférico.​